雖然中水的價格具有一定的優勢，已能在缺水城市中受到廣泛的認同，但在利用中仍然存在著認識上的誤區，這也是阻礙中水發展的一個很大的原因。

一些用過中水的居民對于使用中水沖廁所基本上都比較認同，但也提出了一些疑問。就曾有居民提出中水用起來還行，就是需要再改進，因為感覺有點兒味，有異色。有異色其實是因為高污廠過來的水，有一部分氨氮，又因為二級排放標準里面，允許有一部分氨氮，還有磷等高于生活飲用水標準的物質，經過光線反映到人的肉眼以后就有顏色了，但這些都不會給能使用中水的場合留下隱患和異常。

中水的水質也是居民有疑慮最不放心的，認為中水是從污水處理來的，感覺有點兒臟。其實這是心理作用，因為都知道中水來源是污水——很臟，就覺得中水回用的話也很臟，實際上它是經過深度處理的。其實再生回用的水與污水處理廠的出廠水不是一回事，再生水是對污水處理廠處理過的水再進行深度處理，達到國家再生水的使用標準，僅次于自來水的水質，臟只是人們的一種心理感覺而已。但中水畢竟是污水的再生水，屬于人體非接觸用水，不可以用于洗衣服、做飯、洗澡等，如果要用的話，還要再經過進一步深度處理才行。